狭い島式ホーム

　美乃坂本駅は小さな駅舎を持つ業務委託駅です。無人時間帯も多くあります。
ホームは島式ホームですが、幅は狭くなっています。

自動券売機が設置されています。

日中は有人ですが、早朝・夜間や昼の時間帯は無人になります。

ホームへは跨線橋で結ばれています。

ホームは島式ホーム１面２線です。

ホームは屋根の無い箇所も多くあります。

中津川よりはほとんど屋根がありません。

駅前は住宅街です。